Ионизирующее излучение применяют для стерилизации одноразовой пластиковой микробиологической посуды, питательных сред, перевязочных материалов, лекарственных препаратов и др.
Однако имеются бактерии, устойчивые к действию ионизирующих излучений, например Micrococcus radiodurans был выделен из ядерного реактора. Неионизирующее излучение (ультрафиолетовые и инфракрасные лучи солнечного света), а также ионизирующее излучение (гамма-излучение радиоактивных веществ) и электроны высоких энергий губительно действуют на микробы уже через короткий промежуток времени.
Ультрафиолетовые лучи применяют для обеззараживания воздуха и различных предметов в больницах, родильных домах, микробиологических лабораториях. С этой целью используют бактерицидные лампы ультрафиолетового излучения с длиной волны 200—450 нм.