В верхние дыхательные пути попадают пылевые частицы, «нагруженные» микроорганизмами, большая часть которых задерживается в носо- и ротоглотке. Здесь обитают бактероиды, коринеформные бактерии, гемофильные палочки, пептококки, лактобактерии, стафилококки, стрептококки, непатогенные нейс-серии и др. Трахея и бронхи обычно стерильны.
- Бактерия.
Микрофлора пищеварительного тракта является наиболее представительной по качественному и количественному составу. Микроорганизмы свободно обитают в полости пищеварительного тракта, а также колонизируют слизистые оболочки в виде биологической пленки.